RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARPC5O15511 151 aa9.54□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE6DO43924 150 aa9.54□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.54□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM18Q96B42 140 aa9.54□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.53□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL4Q99706 377 aa9.53□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCE1O60756 84 aa9.52□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.52□□□□□ -0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 C22orf24Q9Y442 160 aa9.52□□□□□ -0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.51□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0087Q14695 138 aa9.5□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BORCS7Q96B45 105 aa9.5□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R17O96001 155 aa9.49□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.49□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.49□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.48□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.48□□□□□ -0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB4AP20338 218 aa9.47□□□□□ -0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.47□□□□□ -0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf82Q6UX34 121 aa9.46□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF727A8MUV8 499 aa9.45□□□□□ -0.9
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 HBBP68871 147 aa9.45□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF345Q14585 488 aa9.45□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OCC1Q8TAD7 63 aa9.45□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.45□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R2P9O14990 202 aa9.44□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCAPO15273 167 aa9.44□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.44□□□□□ -0.9
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFC1BP0CG36 223 aa9.43□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMN1Q8IY45 258 aa9.43□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.42□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM104AQ969W3 186 aa9.42□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.41□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMKR1H3BMG3 65 aa9.41□□□□□ -0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2AP49459 152 aa9.41□□□□□ -0.9
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRACQ8N912 160 aa9.41□□□□□ -0.9
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKS1BP61024 79 aa9.38□□□□□ -0.91
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.37□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIGD1CA8MV81 97 aa9.37□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf78Q9BR46 151 aa9.37□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.36□□□□□ -0.91
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE2CQ5TA81 110 aa9.36□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GVG6 124 aa9.34□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMSDA8MTL9 139 aa9.34□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIGQ13278 110 aa9.34□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.34□□□□□ -0.91
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00862A6NCI5 91 aa9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMLR1H3BR10 107 aa9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZN92 141 aa9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.33□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.32□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8IZM0 81 aa9.32□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE10A6NGK3 116 aa9.31□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1HP80294 61 aa9.31□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.3□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8VRH5 84 aa9.29□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.29□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM141Q96I45 108 aa9.29□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM250H0YL14 139 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNFRSF6BO95407 300 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKS2P33552 79 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.28□□□□□ -0.92
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.27□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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