RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 C11orf86A6NJI1 115 aa15.75■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 DPM2O94777 84 aa15.75■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 IGKCP01834 107 aa15.74■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 COX6A2Q02221 97 aa15.74■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 REG3AQ06141 175 aa15.74■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.74■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 Q9H8V8 135 aa15.74■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 CASC10Q5T4H9 136 aa15.73■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 ENHOQ6UWT2 76 aa15.73■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.73■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.73■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.72■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.72■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.72■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 PRR34Q9NV39 138 aa15.72■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.72■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 NFE4Q86UQ8 179 aa15.71■□□□□ 0.11
CNN3-202ENST00000394202 PLNP26678 52 aa15.71■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.7■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.69■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.69■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 UBE2WQ96B02 151 aa15.69■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 UBE2V1Q13404 147 aa15.69■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.69■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 TAX1BP3O14907 124 aa15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 PTTG1IPP53801 180 aa15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZVH6 145 aa15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.67■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 CCL25O15444 150 aa15.66■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 XCL1P47992 114 aa15.66■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.66■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 SEC11AP67812 179 aa15.66■□□□□ 0.1
CNN3-202ENST00000394202 C3orf84H3BNL1 204 aa15.64■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 SS18Q15532 418 aa15.64■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 CRPP02741 224 aa15.64■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 HERVK_113P63121 156 aa15.64■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.63■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.62■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 KMT2AQ03164 3969 aa15.62■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.62■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 Q9HAA7 133 aa15.61■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 HSD52Q0P140 79 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 TMEM223A0PJW6 202 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 VAMP3Q15836 100 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 MIAQ16674 131 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 C5orf38Q86SI9 138 aa15.6■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 SPINK8P0C7L1 97 aa15.59■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 NMUP48645 174 aa15.59■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.58■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa15.58■□□□□ 0.09
CNN3-202ENST00000394202 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.58■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.57■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 A6NDN8 102 aa15.57■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 FOXI1Q12951 378 aa15.57■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 PCP2Q8IVA1 136 aa15.57■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.56■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.56■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 HIGD1BQ9P298 99 aa15.56■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 A0A087WZ39 114 aa15.55■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.55■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 DNAH10Q8IVF4 4471 aa15.54■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.54■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa15.54■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.54■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 LY6G6CO95867 125 aa15.54■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 E9PLD3 99 aa15.53■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 H3BRM9 83 aa15.53■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 K7EP13 123 aa15.53■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.53■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.53■□□□□ 0.08
CNN3-202ENST00000394202 LINC00476Q8WZB0 136 aa15.52■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 M0R2N4 97 aa15.51■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 COX7A2LO14548 114 aa15.51■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 HERVK_113P61574 105 aa15.51■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.5■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.5■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.5■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.49■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 C9orf118A6NHY6 69 aa15.48■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 LEPROTO15243 131 aa15.47■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 TTC32Q5I0X7 151 aa15.46■□□□□ 0.07
CNN3-202ENST00000394202 J3QQQ9 107 aa15.45■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 MALP21145 153 aa15.45■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZR54 194 aa15.44■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.44■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.42■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.42■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 DNAH2Q9P225 4427 aa15.42■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 TAL2Q16559 108 aa15.41■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.41■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 RMI2Q96E14 147 aa15.41■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.41■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 GAGE10A6NGK3 116 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms