RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 PARP14Q460N5 1801 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 CORTO00230 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBE2D3P61077 147 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBE2D2P62837 147 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q0VG73 95 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZANQ9Y493 2812 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 RYR2Q92736 4967 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRDM2Q13029 1718 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 H3BQ15 152 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 COX6CP09669 75 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNG4P50150 75 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SVBPQ8N300 66 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATRQ13535 2644 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCAPERQ9BY12 1400 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A1B0GWA3 101 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP3R1P63098 170 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRO1933Q9H354 126 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAPPAQ13219 1627 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM223BA6NKX1 122 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 LCN9Q8WX39 176 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 USMG5Q96IX5 58 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNG8Q9UK08 70 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLXNB2O15031 1838 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPTA1P02549 2419 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACANP16112 2415 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 COX8AP10176 69 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 S100A1P23297 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM203Q969S6 136 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 C12orf57Q99622 126 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADGRL2O95490 1459 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-190P-201ENST00000384154 M0R2T5 61 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 HERC1Q15751 4861 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYOM2P54296 1465 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 HERC2O95714 4834 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 DOCK1Q14185 1865 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNCAP37840 140 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 COL6A3P12111 3177 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTDAPP60985 99 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 CGREF1Q99674 301 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 TET3O43151 1660 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYOM1P52179 1685 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.5 ms