RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.73■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.73■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 H3BUT2 72 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-30P01768 117 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GUV1 79 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 MDFIQ99750 246 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.72■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0J9YWU9 116 aa15.71■□□□□ 0.11
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZTC4 211 aa15.7■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 Q8N3U1 123 aa15.69■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 LITAFQ99732 161 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 TENM3Q9P273 2699 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GWB2 263 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 K7EIL1 84 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2V1Q13404 147 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.68■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM238C9JI98 176 aa15.67■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.66■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.66■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 A6NJY4 79 aa15.66■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFA1O15239 70 aa15.66■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 CCL25O15444 150 aa15.66■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.65■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.65■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.65■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 Q9H8V8 135 aa15.65■□□□□ 0.1
VSTM4-201ENST00000298454 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.64■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 LELP1Q5T871 98 aa15.64■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.64■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 MRAPQ8TCY5 172 aa15.63■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPM0 123 aa15.63■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.63■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 IGLL5B9A064 214 aa15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 APOMO95445 188 aa15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf38Q86SI9 138 aa15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 XCL1P47992 114 aa15.61■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.61■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 SS18Q15532 418 aa15.6■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA25Q9BR10 227 aa15.6■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WZ39 114 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 A4D1N5 150 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 H3BNG1 76 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS2P07478 247 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 CFC1BP0CG36 223 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 CFC1P0CG37 223 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 SPANXCQ9NY87 97 aa15.59■□□□□ 0.09
VSTM4-201ENST00000298454 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.58■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE10A6NGK3 116 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 TIMM17BO60830 172 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 NPC2P61916 151 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 MIAQ16674 131 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 DAND5Q8N907 189 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 COX7B2Q8TF08 81 aa15.57■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 FABP2P12104 132 aa15.56■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 REG3AQ06141 175 aa15.56■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.56■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.56■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0U1RRA0 63 aa15.55■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 SPCS1Q9Y6A9 102 aa15.55■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.54■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 K7EP34 96 aa15.54■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.52■□□□□ 0.08
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN13O95857 204 aa15.52■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 HERV-K104P63124 156 aa15.52■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.52■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 KLK12Q9UKR0 248 aa15.51■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.5■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.5■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.49■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-33P01772 117 aa15.49■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 ESRGQ1W209 222 aa15.48■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 SFTA2Q6UW10 78 aa15.48■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0B4J2C4 111 aa15.48■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 IFITM1P13164 125 aa15.46■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.46■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 PRR34Q9NV39 138 aa15.46■□□□□ 0.07
VSTM4-201ENST00000298454 COX7A2LO14548 114 aa15.45■□□□□ 0.06
VSTM4-201ENST00000298454 ENHOQ6UWT2 76 aa15.45■□□□□ 0.06
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.45■□□□□ 0.06
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.45■□□□□ 0.06
VSTM4-201ENST00000298454 FOXI1Q12951 378 aa15.44■□□□□ 0.06
VSTM4-201ENST00000298454 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.44■□□□□ 0.06
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