RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 FOXI1Q12951 378 aa13.56□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 GAGE6Q13070 117 aa13.56□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 F5H768 121 aa13.56□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 IFITM1P13164 125 aa13.56□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 H7C423 109 aa13.55□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 TRIAP1O43715 76 aa13.55□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 NOTCH2Q04721 2471 aa13.55□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 INAFM1C9JVW0 142 aa13.55□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 A0A0U1RRA0 63 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 RNF183Q96D59 192 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.54□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.53□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 C9JAW5 83 aa13.53□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 TEN1Q86WV5 123 aa13.53□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.52□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 ATXN8Q156A1 80 aa13.52□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.52□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa13.52□□□□□ -0.24
USP21-201ENST00000289865 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.52□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 SLC25A20O43772 301 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 CARD19Q96LW7 228 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 SPATA25Q9BR10 227 aa13.51□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.5□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.5□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 X6R8D5 127 aa13.5□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.49□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.49□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 SIGMAR1Q99720 223 aa13.49□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 LINC01620Q4KN68 170 aa13.48□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.48□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 GYPEP15421 78 aa13.47□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 HERV-K104P63124 156 aa13.47□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.47□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 VWFP04275 2813 aa13.46□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 COX6CP09669 75 aa13.46□□□□□ -0.25
USP21-201ENST00000289865 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.45□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 M0QXV9 152 aa13.45□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 COX7B2Q8TF08 81 aa13.45□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 COPS9Q8WXC6 57 aa13.44□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 CLEC2BQ92478 149 aa13.44□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.44□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.43□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 DEFB135Q30KP9 77 aa13.42□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.42□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa13.42□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.41□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 PRO0255Q9UI72 69 aa13.41□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 CDIP1Q9H305 208 aa13.41□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 A0A096LPF7 62 aa13.4□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 DEFB4AO15263 64 aa13.4□□□□□ -0.26
USP21-201ENST00000289865 TMEM262E9PQX1 116 aa13.39□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.39□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 LYRM9A8MSI8 78 aa13.39□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 C5orf38Q86SI9 138 aa13.39□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 LST1O00453 97 aa13.38□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 TENM1Q9UKZ4 2725 aa13.38□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 A0A087WZ39 114 aa13.38□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 PAX4O43316 350 aa13.38□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 APOC4P55056 127 aa13.37□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 C2orf82Q6UX34 121 aa13.37□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 LINC01600Q96MT4 127 aa13.37□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 CITED1Q99966 193 aa13.37□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa13.35□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.35□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GUV1 79 aa13.34□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 SCGB1A1P11684 91 aa13.34□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.34□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 PPDPFQ9H3Y8 114 aa13.34□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 XCL1P47992 114 aa13.34□□□□□ -0.27
USP21-201ENST00000289865 HIVEP1P15822 2718 aa13.33□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.33□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 LINC00158P58513 81 aa13.33□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.33□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 H3BT86 120 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 DAD1P61803 113 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 SS18Q15532 418 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 UBE2WQ96B02 151 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 ATRQ13535 2644 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 COX7A2LO14548 114 aa13.32□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 CELA1Q9UNI1 258 aa13.31□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.3□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 XGP55808 180 aa13.3□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 MT-ATP8P03928 68 aa13.3□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 Q8NAQ8 132 aa13.3□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.3□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.29□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 PFN2P35080 140 aa13.29□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
USP21-201ENST00000289865 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 210.3 ms