RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1118A0A0J9YUE7 307 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav12d-1A0N8R0 115 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21616B6ZB74 166 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r224E9PWK2 298 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tm4sf19E9Q9H8 206 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10203F6QJ09 66 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esp8F7AMQ8 149 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21244J3QK38 227 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20873J3QMQ9 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20795J3QP49 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21310J3QQ23 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 F2rl2O08675 369 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LfngO09010 378 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TcapO70548 167 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem95P0DJF3 176 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ssty1P13675 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gabra6P16305 453 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P18528 98 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fcer1gP20491 86 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp36l1P23950 338 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LalbaP29752 143 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxa2P35583 459 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pfn1P62962 140 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pax5Q02650 391 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhrs2Q149L0 282 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1700009N14RikQ14AA6 216 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rhox4gQ2MDF7 205 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defb30Q30KN4 75 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21440Q3TTD8 232 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5615Q3UW02 101 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psg27Q497W2 474 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zdhhc23Q5Y5T3 425 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp273Q7M6W8 501 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1204Q7TR10 309 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp799Q8BHK4 648 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss58Q8BW11 241 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim4Q8C1Q6 80 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8C708 225 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A730015C16RikQ8C992 119 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem56Q8CGF5 276 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1444Q8VFX2 319 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1446Q8VFX4 308 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mpv17lQ99MS3 194 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sval2Q99N75 144 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Flywch2Q9CQE9 139 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrps36Q9CQX8 102 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Urm1Q9D2P4 101 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hspb9Q9DAM3 168 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr945Q9EQB5 319 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rhox4bQ9JI43 205 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cml1Q9JIZ0 222 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1264Q9R0K2 308 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ntn3Q9R1A3 580 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pus1Q9WU56 423 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa4.14□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr709-ps1A0A140T8J9 307 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr588-ps1A0A1B0GSZ2 313 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr920E9Q413 310 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr609E9Q4X7 319 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20825J3QM67 227 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bet1lO35153 111 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B2mP01887 119 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P04212 136 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PpyP10601 100 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hspb1P14602 209 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P18529 117 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1537P34983 314 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 G6pcP35576 357 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcpt8P43430 247 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acrv1P50289 261 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tas2r41P59532 308 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RanP62827 216 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdk2P97377 346 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ssty2Q149W4 227 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q3U595 105 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spint3Q3UW09 88 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm94Q3V2D2 93 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Samt2Q497M0 247 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21394Q497R7 227 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20854Q62461 227 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Morn2Q6UL01 79 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtch1Q791T5 389 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr4Q8BUD0 365 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Timm21Q8CCM6 249 aa4.13□□□□□ -1.75
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AamdcQ8R0P4 122 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.6 ms