Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Gabra6P16305 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gabra6P16305 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gabra6P16305 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gabra6P16305 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gabra6P16305 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabra6P16305 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gabra6P16305 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gabra6P16305 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gabra6P16305 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gabra6P16305 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabra6P16305 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabra6P16305 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gabra6P16305 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gabra6P16305 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gabra6P16305 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gabra6P16305 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gabra6P16305 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gabra6P16305 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabra6P16305 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabra6P16305 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gabra6P16305 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabra6P16305 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabra6P16305 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabra6P16305 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabra6P16305 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabra6P16305 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabra6P16305 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabra6P16305 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabra6P16305 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabra6P16305 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabra6P16305 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabra6P16305 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabra6P16305 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabra6P16305 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gabra6P16305 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gabra6P16305 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabra6P16305 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabra6P16305 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabra6P16305 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabra6P16305 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabra6P16305 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabra6P16305 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabra6P16305 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabra6P16305 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra6P16305 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra6P16305 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabra6P16305 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabra6P16305 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabra6P16305 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra6P16305 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabra6P16305 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra6P16305 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabra6P16305 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabra6P16305 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra6P16305 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra6P16305 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabra6P16305 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabra6P16305 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabra6P16305 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabra6P16305 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabra6P16305 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabra6P16305 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gabra6P16305 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabra6P16305 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabra6P16305 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabra6P16305 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabra6P16305 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabra6P16305 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabra6P16305 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabra6P16305 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabra6P16305 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabra6P16305 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabra6P16305 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabra6P16305 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabra6P16305 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabra6P16305 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabra6P16305 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabra6P16305 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabra6P16305 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabra6P16305 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabra6P16305 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabra6P16305 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabra6P16305 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabra6P16305 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabra6P16305 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabra6P16305 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra6P16305 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabra6P16305 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms