Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS3

Mpv17l, Mpv17-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpv17lQ99MS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Mpv17lQ99MS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mpv17lQ99MS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mpv17lQ99MS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mpv17lQ99MS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mpv17lQ99MS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mpv17lQ99MS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mpv17lQ99MS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mpv17lQ99MS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mpv17lQ99MS3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mpv17lQ99MS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mpv17lQ99MS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mpv17lQ99MS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mpv17lQ99MS3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mpv17lQ99MS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mpv17lQ99MS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mpv17lQ99MS3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mpv17lQ99MS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mpv17lQ99MS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mpv17lQ99MS3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mpv17lQ99MS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mpv17lQ99MS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mpv17lQ99MS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mpv17lQ99MS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mpv17lQ99MS3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mpv17lQ99MS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mpv17lQ99MS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mpv17lQ99MS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mpv17lQ99MS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mpv17lQ99MS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mpv17lQ99MS3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mpv17lQ99MS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mpv17lQ99MS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mpv17lQ99MS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mpv17lQ99MS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mpv17lQ99MS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mpv17lQ99MS3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mpv17lQ99MS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mpv17lQ99MS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mpv17lQ99MS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mpv17lQ99MS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mpv17lQ99MS3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mpv17lQ99MS3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mpv17lQ99MS3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mpv17lQ99MS3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mpv17lQ99MS3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mpv17lQ99MS3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mpv17lQ99MS3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mpv17lQ99MS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mpv17lQ99MS3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mpv17lQ99MS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mpv17lQ99MS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mpv17lQ99MS3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mpv17lQ99MS3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mpv17lQ99MS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mpv17lQ99MS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mpv17lQ99MS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mpv17lQ99MS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mpv17lQ99MS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mpv17lQ99MS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mpv17lQ99MS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mpv17lQ99MS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mpv17lQ99MS3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mpv17lQ99MS3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mpv17lQ99MS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mpv17lQ99MS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mpv17lQ99MS3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mpv17lQ99MS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mpv17lQ99MS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mpv17lQ99MS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mpv17lQ99MS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mpv17lQ99MS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mpv17lQ99MS3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mpv17lQ99MS3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mpv17lQ99MS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mpv17lQ99MS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mpv17lQ99MS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mpv17lQ99MS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mpv17lQ99MS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mpv17lQ99MS3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mpv17lQ99MS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mpv17lQ99MS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mpv17lQ99MS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mpv17lQ99MS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mpv17lQ99MS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mpv17lQ99MS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mpv17lQ99MS3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mpv17lQ99MS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mpv17lQ99MS3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mpv17lQ99MS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mpv17lQ99MS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mpv17lQ99MS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mpv17lQ99MS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mpv17lQ99MS3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mpv17lQ99MS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mpv17lQ99MS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mpv17lQ99MS3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mpv17lQ99MS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mpv17lQ99MS3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mpv17lQ99MS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms