RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.99□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q6ZUT4 128 aa6.99□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.99□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.99□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A096LNJ9 63 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00310P59036 64 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKIAP61925 76 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM101Q96IK0 257 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRR34Q9NV39 138 aa6.98□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGIPA6NJ69 53 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q0VG73 95 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WFDC2Q14508 124 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BAGE3Q86Y29 109 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKD1P98161 4303 aa6.97□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.96□□□□□ -1.29
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 K7EP13 123 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LECT2O14960 151 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BKO60814 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRPP02741 224 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BJP06899 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BOP23527 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BBP33778 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BDP58876 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BCP62807 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BAALCQ8WXS3 180 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM18Q96B42 140 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOMM6Q96B49 74 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.96□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SERF1AO75920 110 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 K7EMI3 77 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIAQ16674 131 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NFE4Q86UQ8 179 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.94□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A087WTM6 91 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCL25O15444 150 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSCAO43653 123 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 XCL1P47992 114 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB5BP61020 215 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX6A2Q02221 97 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TM2D2Q9BX73 214 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HBDP02042 147 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFA6P56556 154 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERASQ7Z444 233 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RMI2Q96E14 147 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM141Q96I45 108 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AMELXQ99217 191 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VCX2Q9H322 139 aa6.92□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GVY2 172 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFITM10A6NMD0 228 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-2P60368 255 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXI1Q12951 378 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SS18Q15532 418 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TIMM17AQ99595 171 aa6.91□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSBP1O75506 76 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FABP4P15090 132 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 G0S2P27469 103 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C5orf38Q86SI9 138 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CST9LQ9H4G1 147 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKHD1P08F94 4074 aa6.9□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0J9YXV3 536 aa6.89□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USP17L23D6RBM5 183 aa6.89□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2D1P51668 147 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms