RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 SMR3AQ99954 134 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 Q96MF0 132 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PPR1 153 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 CGB1A6NKQ9 187 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 VCYO14598 125 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 S4R3C0 116 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 IGIPA6NJ69 53 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 NXPH4O95158 308 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-69P01742 117 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-218ENST00000590367 NACAE9PAV3 2078 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 SOCS3O14543 225 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 U3KQE9 123 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 AVPP01185 164 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 CCKP06307 115 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.497e-7■■■■□ 24.2
EFTUD2-218ENST00000590367 H7BZZ5 65 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV1-17P01599 117 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR15Q8IV56 129 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TSHBP01222 138 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 CFHR3Q02985 330 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF223E7ERA6 249 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 KLKP1Q107X0 134 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 I3L2K1 104 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 DPM3Q9P2X0 92 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 F8WEM9 126 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV2-23P01705 113 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZRU5 148 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 STHQ8IWL8 128 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00846Q9NV44 126 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV12-3P01733 135 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-23P01764 117 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 DAD1P61803 113 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 BLCAPP62952 87 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PDZD2O15018 2839 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 SAA4P35542 130 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 LITAFQ99732 161 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 A8MZ25 164 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 LY6G6DO95868 133 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 MED14OSP0DP75 135 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 SS18Q15532 418 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 ATRQ13535 2644 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 PAX4O43316 350 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 ECSCRQ19T08 205 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZSV7 163 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF575Q86XF7 245 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0J9YXV3 536 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 INAFM1C9JVW0 142 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 UBL5Q9BZL1 73 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 F5H697 171 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms