RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.08□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 TSHBP01222 138 aa11.08□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 CFC1BP0CG36 223 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 CFC1P0CG37 223 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 TOMM6Q96B49 74 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 F8VRH5 84 aa11.07□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.07□□□□□ -0.64
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CTIF-205ENST00000587860 H7C1H1 209 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.06□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.06□□□□□ -0.64
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CTIF-205ENST00000587860 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 C11orf86A6NJI1 115 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 Q1RN00 199 aa11.05□□□□□ -0.64
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.04□□□□□ -0.64
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CTIF-205ENST00000587860 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 H3BMM0 161 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-205ENST00000587860 PLNP26678 52 aa11.03□□□□□ -0.64
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CTIF-205ENST00000587860 HERVK_113P61574 105 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZSN1 163 aa11.02□□□□□ -0.65
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CTIF-205ENST00000587860 ESM1Q9NQ30 184 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-205ENST00000587860 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11□□□□□ -0.65
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CTIF-205ENST00000587860 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-33P01772 117 aa10.94□□□□□ -0.66
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CTIF-205ENST00000587860 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 IL17DQ8TAD2 202 aa10.93□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R17O96001 155 aa10.92□□□□□ -0.66
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CTIF-205ENST00000587860 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.91□□□□□ -0.66
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