RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM231AP0DMU4 169 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM231CP0DMU5 169 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 FCER1GP30273 86 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 DKK2Q9UBU2 259 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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PRKAR1A-211ENST00000586397 DEFB130AP0DP74 79 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 VPREB1P12018 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 TM2D2Q9BX73 214 aa6.27□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 TSPAN13O95857 204 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 C5orf47Q569G3 176 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.27□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 HERV-K104P63124 156 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB37Q96AX2 223 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC01549A6NIU2 74 aa6.25□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.24□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE6Q13070 117 aa6.22□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.22□□□□□ -1.41
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PRKAR1A-211ENST00000586397 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRKAR1A-211ENST00000586397 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A0J9YWU9 116 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 PAX4O43316 350 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKCP01834 107 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRSS1P07477 247 aa6.19□□□□□ -1.42
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