RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 GAGE6Q13070 117 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RIGQ13278 110 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ESRGQ1W209 222 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZVH6 145 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 VCX2Q9H322 139 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 F5H697 171 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 PMCHP20382 165 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RASL11AQ6T310 242 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 HERC1Q15751 4861 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GVY2 172 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 M0QY20 66 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 MGPP08493 103 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 FABP2P12104 132 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 UBE2D3P61077 147 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 UBE2D2P62837 147 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GATD1Q8NB37 220 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ERG28Q9UKR5 140 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GXF2 115 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GAGE12JA6NER3 117 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 HERV-K104P63124 156 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GAGE4Q13068 117 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GAGE13Q4V321 117 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 F8W1H4 67 aa6.77□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 HBBP68871 147 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 LELP1Q5T871 98 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 ERASQ7Z444 233 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 Q9UF83 564 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PPM0 123 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 RNF185Q96GF1 192 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 Q9H8V8 135 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.76□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 PPP1R17O96001 155 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 C5orf47Q569G3 176 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 TTC32Q5I0X7 151 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 PKD1P98161 4303 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 CAMPP49913 170 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 AMN1Q8IY45 258 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 C6orf223Q8N319 242 aa6.74□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 PKHD1P08F94 4074 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 APCSP02743 223 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 COX8AP10176 69 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.72□□□□□ -1.33
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GGA3-209ENST00000580646 TNP2Q05952 138 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 ATOH7Q8N100 152 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-209ENST00000580646 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 NRACQ8N912 160 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 C20orf78Q9BR46 151 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-209ENST00000580646 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.7□□□□□ -1.34
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