RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	PHOX2A	O14813	284 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	NCR2	O95944	276 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GXF2	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777		H7C423	109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	APCS	P02743	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	APOC3	P02656	99 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	FGF6	P10767	208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	CAMP	P49913	170 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	RIG	Q13278	110 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	STPG4	Q8N801	248 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PMCH	P20382	165 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	FOXI1	Q12951	378 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDX11-222	ENST00000542777	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777		A0A096LNI7	61 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777		I3L3M4	83 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	RAB4A	P20338	218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	XCL1	P47992	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	HBB	P68871	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	CCL25	O15444	150 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	RHEB	Q15382	184 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	ESD	P10768	282 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	ST20	Q9HBF5	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	TSHB	P01222	138 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	SS18	Q15532	418 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	SVBP	Q8N300	66 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777	TNXB	P22105	4242 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GW15	77 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	SNAPIN	O95295	136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	NRAC	Q8N912	160 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777		D6R8Y8	96 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0J9YXV3	536 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	NPY	P01303	97 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	S100A8	P05109	93 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	ODF1	Q14990	250 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	S100P	P25815	95 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	REG3G	Q6UW15	175 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZRP5	223 aa		9.97	□□□□□ -0.81
DDX11-222	ENST00000542777	VCY	O14598	125 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDX11-222	ENST00000542777	CKS2	P33552	79 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP10-8	P60410	259 aa		9.96	□□□□□ -0.82
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE2B	Q13066	116 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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