RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 TEX261Q6UWH6 196 aa7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 BTF3L4Q96K17 158 aa7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.16□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 H7C423 109 aa7.16□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.16□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 RNF213Q63HN8 5207 aa7.16□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 TSHBP01222 138 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 ADIRFQ15847 76 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 CARD19Q96LW7 228 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 LINC01600Q96MT4 127 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 ST20Q9HBF5 79 aa7.15□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 GAGE2BQ13066 116 aa7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SS18Q15532 418 aa7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 CT83Q5H943 113 aa7.14□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SMKR1H3BMG3 65 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 ESDP10768 282 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SYCNQ0VAF6 134 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 RIGQ13278 110 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 LINC01551Q86U37 167 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 MRAP2Q96G30 205 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 NAT8Q9UHE5 227 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 A0A1B0GUT8 65 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 HIGD1CA8MV81 97 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 TSKUQ8WUA8 353 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 OSTCQ9NRP0 149 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 A0A0J9YXV3 536 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 RAB4AP20338 218 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 MALP21145 153 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 AMN1Q8IY45 258 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 C9JQL5 133 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 FCER1GP30273 86 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 CAMPP49913 170 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP10-8P60410 259 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 IFITM2Q01629 132 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 REG3GQ6UW15 175 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZRP5 223 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 A0A1W2PNN7 141 aa7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 S100A8P05109 93 aa7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 PTTG1IPP53801 180 aa7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 C5orf38Q86SI9 138 aa7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COPB2-211ENST00000513274 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 COX7A2LO14548 114 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 PPP1R17O96001 155 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 ISOC2Q96AB3 205 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.08□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.07□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 VCYO14598 125 aa7.07□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.07□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 NUP35Q8NFH5 326 aa7.07□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 A0A1B0GW15 77 aa7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 F8W036 122 aa7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZUT4 128 aa7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 V9GYV3 84 aa7.06□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 PPP1R2P9O14990 202 aa7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 MT-ND6P03923 174 aa7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 NRACQ8N912 160 aa7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 LPAP08519 4548 aa7.05□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 APOMO95445 188 aa7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 CKS2P33552 79 aa7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 C1orf137Q5JT78 98 aa7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 CLLU1Q5K131 121 aa7.04□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 KIR2DL4Q99706 377 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms