RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490667.1

SHC1-211, Transcript of SHC adaptor protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SHC1, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1-211ENST00000490667 KIR2DL4Q99706 377 aa8.5□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.5□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 A0A1B0GXF2 115 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 CLLU1Q5K131 121 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 C20orf78Q9BR46 151 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.49□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.48□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 TNFRSF6BO95407 300 aa8.48□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 SLPIP03973 132 aa8.48□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 MT-ND4LP03901 98 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 XCL1P47992 114 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 FOXI1Q12951 378 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 SS18Q15532 418 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 C15orf56Q8N910 161 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.47□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.46□□□□□ -1.05
SHC1-211ENST00000490667 D6R8Y8 96 aa8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 CCL25O15444 150 aa8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 PPBPP02775 128 aa8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TCAPO15273 167 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 IFITM2Q01629 132 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TMEM18Q96B42 140 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 PANO1I0J062 215 aa8.44□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 PHOX2AO14813 284 aa8.44□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 NPYP01303 97 aa8.44□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 DPH3Q96FX2 82 aa8.44□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.44□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 ORMDL3Q8N138 153 aa8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 PRELID3AQ96N28 172 aa8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.43□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.42□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 UQCC3Q6UW78 93 aa8.42□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.41□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 TMEM218A2RU14 115 aa8.4□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 RAB5AP20339 215 aa8.4□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 Q6ZUT4 128 aa8.4□□□□□ -1.06
SHC1-211ENST00000490667 PRSS47A8MTI9 375 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 CHTF8P0CG12 524 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 MALP21145 153 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 COX6A2Q02221 97 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.39□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 COX7A2LO14548 114 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 ADCYAP1P18509 176 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 FAM104AQ969W3 186 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 IMMP2LQ96T52 175 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.38□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 A0A087WYN8 130 aa8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 C5orf38Q86SI9 138 aa8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.37□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 CARD19Q96LW7 228 aa8.36□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 SEC11CQ9BY50 192 aa8.36□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 SYCNQ0VAF6 134 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 MAJINQ3KP22 176 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 Q8N8P6 123 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.35□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.34□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 APOMO95445 188 aa8.34□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 COMMD7Q86VX2 200 aa8.34□□□□□ -1.07
SHC1-211ENST00000490667 A0A096LNI7 61 aa8.33□□□□□ -1.08
SHC1-211ENST00000490667 IFITM10A6NMD0 228 aa8.33□□□□□ -1.08
SHC1-211ENST00000490667 J3QL48 77 aa8.33□□□□□ -1.08
SHC1-211ENST00000490667 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.33□□□□□ -1.08
SHC1-211ENST00000490667 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.32□□□□□ -1.08
SHC1-211ENST00000490667 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.32□□□□□ -1.08
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