RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF56Q15929 161 aa12.56□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.56□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0J9YXY3 114 aa12.55□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE5Q13069 117 aa12.55□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE6Q13070 117 aa12.55□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 I3L3M4 83 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6Q795 121 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATRQ13535 2644 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0J9YXV3 536 aa12.54□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H7C2G1 150 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNCGO76070 127 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE2BQ13066 116 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE2EQ4V326 116 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q1RN00 199 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LITAFQ99732 161 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.53□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.51□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIAP1O43715 76 aa12.51□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PF4P02776 101 aa12.51□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.51□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB131AP59861 70 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPANXDQ9BXN6 97 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPANXCQ9NY87 97 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.49□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGKV3-20P01619 116 aa12.49□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.49□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.49□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.48□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BMM0 161 aa12.48□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM104AQ969W3 186 aa12.48□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2WQ96B02 151 aa12.48□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KNCNA6PVL3 124 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BT86 120 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPXQ9BT56 116 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.47□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV1-51P01701 117 aa12.46□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IFITM1P13164 125 aa12.46□□□□□ -0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTC32Q5I0X7 151 aa12.46□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.46□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H7C423 109 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MIAQ16674 131 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2orf82Q6UX34 121 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COX6CP09669 75 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.45□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VWFP04275 2813 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE12JA6NER3 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 B5MCH6 92 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE7O76087 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE12FP0CL80 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE12GP0CL81 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE12IP0CL82 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GAGE4Q13068 117 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.44□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.43□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRSS2P07478 247 aa12.43□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.43□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.42□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.42□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.42□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A8MTW9 85 aa12.42□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TIMM17BO60830 172 aa12.42□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LST1O00453 97 aa12.41□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.41□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.41□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRIMA1Q86XR5 153 aa12.39□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC179H3BU77 68 aa12.39□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BEAN1Q3B7T3 259 aa12.38□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.37□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.37□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.37□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.36□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STHQ8IWL8 128 aa12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.1 ms