RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf78Q9BR46 151 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 S100A8P05109 93 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 FCER1GP30273 86 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 FOXI1Q12951 378 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 Q5VSD8 79 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 FAM104AQ969W3 186 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 EPM2AB3EWF7 344 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 TCAPO15273 167 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 SCXQ7RTU7 201 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM101Q96IK0 257 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 BTF3L4Q96K17 158 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DL4Q99706 377 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 hDV102S1A0JD36 115 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PANO1I0J062 215 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PPBPP02775 128 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 XCL1P47992 114 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZUT4 128 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 ORMDL3Q8N138 153 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PRELID3AQ96N28 172 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 SEC11CQ9BY50 192 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PHOX2AO14813 284 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CCL25O15444 150 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 IMMP2LQ96T52 175 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS47A8MTI9 375 aa6.89□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.89□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 MYCBP2O75592 4640 aa6.89□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 SS18Q15532 418 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 CHTF8P0CG12 524 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 CFAP161Q6P656 301 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N8P6 123 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM18Q96B42 140 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 FAM229AH3BQW9 127 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 RAB5AP20339 215 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf38Q86SI9 138 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 COX6A2Q02221 97 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 COX7A2LO14548 114 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 RHEBQ15382 184 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 IFITM10A6NMD0 228 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 APOC3P02656 99 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 S100PP25815 95 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-210ENST00000428861 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.3 ms