RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 BPY2O14599 106 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDE6GP18545 87 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 ODF3Q96PU9 254 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZMAT4Q9H898 229 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC179H3BU77 68 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 REG3AQ06141 175 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 EBI3Q14213 229 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 F8W735 103 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRM2P04554 102 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUP210LQ5VU65 1888 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 C6orf99Q4VX62 202 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM236CP0DP71 79 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBE2AP49459 152 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSHBP01222 138 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 C19orf84I3L1E1 186 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM222AQ5U5X8 452 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 H0Y9J4 135 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 LST1O00453 97 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A096LNI7 61 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 SVIPQ8NHG7 77 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCANP1Q8TF63 244 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa10.08□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A0U1RQV1 116 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP17L23D6RBM5 183 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDUFA7O95182 113 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.07□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRYGDP07320 174 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 H7C423 109 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.06□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 EML5Q05BV3 1969 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERP2Q8N6R1 65 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNFNQ9BYD5 112 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 SNURFQ9Y675 71 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLLNB2CW77 178 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 FSTL3O95633 263 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCKP06307 115 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZQY7 126 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8N6K4 173 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 IMUPQ9GZP8 106 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 C3orf84H3BNL1 204 aa10.02□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 TIMM17BO60830 172 aa10.02□□□□□ -0.8
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGIPA6NJ69 53 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6YL49 198 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZSV7 163 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 COX7CP15954 63 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A096LNJ9 63 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV4-1P06312 121 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 C9orf85Q96MD7 179 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 LTBP2Q14767 1821 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBE2D1P51668 147 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRR4Q16378 134 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV2D-28P01615 120 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC10-201ENST00000291574 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms