RNA–Protein interactions for RNA: YOR193W

PEX27, Transcript of Peripheral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX27, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX27	YOR193W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YEL076C	P39971	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	RAD33	Q04231	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	MAK32	P23060	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	COQ3	P27680	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	CDC5	P32562	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	DSS4	P32601	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	FLO5	P38894	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YAT2	P40017	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	ALG12	P53730	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	CRT10	Q08226	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	NDD1	Q08887	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	DGR2	P32330	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	PEF1	P53238	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	SNA4	Q07549	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	THI73	Q07904	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	HXT4	P32467	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	GDA1	P32621	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	DID4	P36108	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	DNM1	P54861	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	PCK1	P10963	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	BET2	P20133	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	ADR1	P07248	1323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YTA7	P40340	1379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	FTH1	P38310	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	MDV1	P47025	714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	HLJ1	P48353	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	GAL4	P04386	881 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	CIN1	P40987	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	SDH8	P38345	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YIL152W	P40455	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
PEX27	YOR193W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	ATP12	P22135	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	MNN1	P39106	762 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
PEX27	YOR193W	SEC12	P11655	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YIR016W	P40572	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	ATX2	Q12067	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	CBP3	P21560	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	AEP2	P22136	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	CIR1	P42940	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	GPG1	P53130	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	RNH70	P53331	553 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YNL058C	P53947	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	BOP3	P53958	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	UBX3	Q12229	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YCR043C	P25361	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	MTG2	P38860	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	UME1	Q03010	460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YML119W	Q03208	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	RAD34	Q06665	692 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX27	YOR193W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	AMD2	P22580	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	CWH43	P25618	953 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	IRC5	P43610	853 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	COG2	P53271	262 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	LCB4	Q12246	624 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	PPG1	P32838	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	VPS8	P39702	1274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	LAS21	P40367	830 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	VTC3	Q02725	835 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	ARA2	Q04212	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	VPS5	Q92331	675 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	PLC1	P32383	869 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	PMT3	P47190	753 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	DSE3	Q08729	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	PFA4	Q12006	378 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX27	YOR193W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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