RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	INA17	Q02888	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	EAR1	Q03212	550 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	GCN5	Q03330	439 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	HER2	Q03557	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	ARA2	Q04212	335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	MPC54	Q08550	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	LCB4	Q12246	624 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDR2	YOL052C-A	TAO3	P40468	2376 aa		11.21	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	CAB3	P36076	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	STB5	P38699	743 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	RAD26	P40352	1085 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YIR016W	P40572	265 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ZIP2	P53061	704 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.2	□□□□□ -0.62	not detected
DDR2	YOL052C-A	HOS1	Q12214	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.2	□□□□□ -0.62	RIP-Chip
DDR2	YOL052C-A	NDJ1	Q12366	352 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	TSR4	P25040	408 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YCR051W	P25631	222 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	KIP2	P28743	706 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MAC1	P35192	417 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SET3	P36124	751 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ECM13	P38195	257 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PPE1	P38796	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SPC97	P38863	823 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	VPS41	P38959	992 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YEL028W	P39989	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	TAH11	P47112	604 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PIG1	Q06216	648 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ADY2	P25613	283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	NUP60	P39705	539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YAT2	P40017	923 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YNL144C	P53907	740 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	INP2	Q03824	705 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	NCA2	Q12374	616 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ERR1	P0CX10	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ERR2	P0CX11	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	CDC20	P26309	610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	RAD16	P31244	790 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SMF2	P38778	549 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ATM1	P40416	690 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MAF1	P41910	395 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ERR3	P42222	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	TRS85	P46944	698 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SNG1	P46950	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	VHS3	Q08438	674 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SPE1	P08432	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PDE1	P22434	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	AIM26	P32858	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PEX5	P35056	612 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SQT1	P35184	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	REV7	P38927	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	DSN1	P40568	576 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SLT2	Q00772	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MRS2	Q01926	470 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	FAR8	Q05040	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	URK1	P27515	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SEC6	P32844	805 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	SAF1	P38352	637 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	VAC8	P39968	578 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	CNN1	P43618	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	MET14	Q02196	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	AHC1	Q12433	566 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDR2	YOL052C-A	GPA2	P10823	449 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	URA10	P30402	227 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SYN8	P31377	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	UTR2	P32623	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YBP1	P38315	674 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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