RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	ATG36	P46983	293 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PIP2	P52960	996 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	COQ6	P53318	479 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	TRI1	Q05024	226 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	DIN7	Q12086	430 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	FRE7	Q12333	620 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	MPD2	Q99316	277 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	WHI2	P12611	486 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	BET2	P20133	325 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CBP3	P21560	335 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	APN1	P22936	367 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	GAT1	P43574	510 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ASK10	P48361	1146 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SAP4	P53036	818 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SEG1	Q04279	960 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
YLR224W	YLR224W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PMA2	P19657	947 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	MBR1	P23493	339 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	AAD3	P25612	363 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SWD1	P39706	426 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ARP7	Q12406	477 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ADH4	P10127	382 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	YKL133C	P36066	463 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SDH8	P38345	138 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	STB5	P38699	743 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	IMA5	P40884	581 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	MET14	Q02196	202 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ENT2	Q05785	613 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CRT10	Q08226	957 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	AAC1	P04710	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ATP4	P05626	244 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PTP1	P25044	335 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CDC5	P32562	705 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	YPT10	P38146	199 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	VFA1	P40080	203 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	OPT1	P40897	799 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	COS12	P53053	380 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	TRS31	Q03337	283 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	MLC2	Q06580	163 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CRD1	Q07560	283 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	HOT13	P36078	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YFL015C	P43578	164 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	POL31	P46957	487 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	IDS2	P46958	469 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	NET1	P47035	1189 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	AAD4	Q07747	329 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PCL8	Q08966	492 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YOL114C	Q12322	202 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CTT1	P06115	562 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PTP2	P29461	750 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RPC34	P32910	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	LNP1	P38878	278 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	WAR1	Q03631	944 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	VPS64	Q03944	604 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CIR2	Q08822	631 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	NYV1	Q12255	253 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	GAL1	P04385	528 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YCR061W	P25639	631 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MRPL9	P31334	269 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RAD26	P40352	1085 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	TDA10	P42938	290 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MAD3	P47074	515 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	TEP1	P53916	434 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	GEP3	Q08622	556 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RGT2	Q12300	763 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	DNA2	P38859	1522 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	APD1	P38281	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MAM1	P40065	302 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	HIS6	P40545	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	QRI7	P43122	407 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YJL043W	P47053	257 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YNL092W	P53934	400 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ACS1	Q01574	713 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	IRC3	Q06683	689 aa		3.37	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms