RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	ARG1	P22768	420 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	APD1	P38281	316 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	YIL024C	P40543	189 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	ATG36	P46983	293 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	IRC8	P47046	822 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	PEF1	P53238	335 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	RAD33	Q04231	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YKL063C	YKL063C	AAC1	P04710	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YUR1	P26725	428 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PEA2	P40091	420 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	IRC5	P43610	853 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MDR1	P53258	950 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	CDC5	P32562	705 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	JHD1	P40034	492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MNT3	P40549	630 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	URA3	P03962	267 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	AMD2	P22580	549 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	EUG1	P32474	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MTG2	P38860	518 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MNT2	P53059	558 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	UBP16	Q02863	499 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SKY1	Q03656	742 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	RMP1	Q12530	201 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	GAL4	P04386	881 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SEC12	P11655	471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	ASK1	P35734	292 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PCI8	P40512	444 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	STB2	P46679	850 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	COS12	P53053	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YML053C	Q04978	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	BI2	P03873	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	AEP2	P22136	580 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	TSR4	P25040	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SDH8	P38345	138 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	VPS8	P39702	1274 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YIL092W	P40497	633 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	IRC7	P43623	340 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YPR089W	O13585	888 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	CWH43	P25618	953 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PXL1	P36166	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YJR120W	P47157	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PFA4	Q12006	378 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	VPS5	Q92331	675 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	AIM44	Q99299	758 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MAK32	P23060	363 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	MAD2	P40958	196 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	CIN1	P40987	1014 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	NIT2	P47016	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	SPC105	P53148	917 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YNR071C	P53757	342 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	YOR389W	Q08912	624 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	DIN7	Q12086	430 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKL063C	YKL063C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
YKL063C	YKL063C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	COQ3	P27680	312 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	FTH1	P38310	465 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	ERV46	P39727	415 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	CRT10	Q08226	957 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	YEN1	P40028	759 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	SNA4	Q07549	140 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	HOS1	Q12214	470 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	MAF1	P41910	395 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	COG2	P53271	262 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	PLM2	Q04383	521 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	RAD34	Q06665	692 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	MGM1	P32266	881 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKL063C	YKL063C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88

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