RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	TIM10	P87108	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	SPC19	Q03954	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	PRP28	P23394	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ESL2	P36168	1195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YJL028W	YJL028W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	SIP4	P46954	829 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	SGM1	P47166	707 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	COG1	P53079	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	BSC5	P53755	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	DLT1	Q04216	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	PET122	P10355	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	DSS4	P32601	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	RKM3	P38222	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ELO3	P40319	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	YJR061W	P40355	935 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TAM41	P53230	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	HOF1	Q05080	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TMA10	Q06177	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TAH18	Q12181	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	YLR302C	O13544	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	SOD2	P00447	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	MET3	P08536	511 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YJL028W	YJL028W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	MRP20	P32387	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	NUP120	P35729	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	FMP10	P40098	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	KHA1	P40309	873 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	IRC6	P43615	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	IDS2	P46958	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ZAP1	P47043	880 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	MPS3	P47069	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ECL1	P48235	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	UBC11	P52492	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	MRPL19	P53875	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TAF11	Q04226	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	IZH3	Q07959	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	IRC13	Q08630	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TRM13	Q12383	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	SKM1	Q12469	655 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL028W	YJL028W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	SGF29	P25554	259 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	MAC1	P35192	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	OMA1	P36163	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	MRPL7	P36519	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	YBR225W	P38321	900 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	PSD1	P39006	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	BUL1	P48524	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	INP52	P50942	1183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	SCM3	Q12334	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	PGS1	P25578	521 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	PHO11	P35842	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	PHO12	P38693	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	YJL163C	P46996	555 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	REG1	Q00816	1014 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	YSA1	Q01976	231 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	MFB1	Q04922	465 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	STP3	Q05937	343 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	CDA2	Q06703	312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	MLH3	Q12083	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	NBP2	Q12163	236 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YJL028W	YJL028W	SIR3	P06701	978 aa		4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms