RNA–Protein interactions for RNA: YGR167W

CLC1, Transcript of Clathrin light chain, yeast

Gene CLC1, Length 702 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLC1	YGR167W	PIP2	P52960	996 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	COQ6	P53318	479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	MLC2	Q06580	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	ULA1	Q12059	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	NYV1	Q12255	253 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	WHI2	P12611	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	PTP2	P29461	750 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	HIS6	P40545	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	MAD3	P47074	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	SAP4	P53036	818 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	FMP30	Q02883	468 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	YLF2	P38746	405 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	VFA1	P40080	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	QRI7	P43122	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	TEP1	P53916	434 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	ENT2	Q05785	613 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
CLC1	YGR167W	PMA2	P19657	947 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	VPS34	P22543	875 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	POL31	P46957	487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	IDS2	P46958	469 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	TRS31	Q03337	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLC1	YGR167W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	CDC5	P32562	705 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	SDH8	P38345	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	ATF1	P40353	525 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	HIM1	Q06674	414 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	AAD4	Q07747	329 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	AAC1	P04710	309 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	MSS18	P08593	268 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YFL015C	P43578	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	CRD1	Q07560	283 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	CTT1	P06115	562 aa		5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	MRPL9	P31334	269 aa		5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	IMO32	P53219	342 aa		5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	WAR1	Q03631	944 aa		5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	APM3	P38153	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YHL041W	P38730	149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	TAX4	P47030	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YNL092W	P53934	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	OSW1	Q08692	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	PCL8	Q08966	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	MSH1	P25846	959 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	DPB3	P27344	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	FUI1	P38196	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	EXO1	P39875	702 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	VPS64	Q03944	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	PIF1	P07271	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	SIR1	P21691	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YCR061W	P25639	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YML119W	Q03208	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	CRF1	Q04930	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	CRT10	Q08226	957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	ICL2	Q12031	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLC1	YGR167W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	POL3	P15436	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	GDA1	P32621	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	RPC34	P32910	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	MTG2	P38860	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	LNP1	P38878	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YJL043W	P47053	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	AIM6	Q07716	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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