RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	SEC12	P11655	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	VPS33	P20795	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	DPB3	P27344	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	BEM3	P32873	1128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	MRPL7	P36519	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YLF2	P38746	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YJL193W	P39542	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YAP1802	P53309	568 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	DIP5	P53388	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	HOF1	Q05080	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	PSR2	Q07949	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	SIR1	P21691	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	VFA1	P40080	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	PUG1	P40100	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	UBA2	P52488	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	SSL2	Q00578	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	GTR1	Q00582	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YML131W	Q03102	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ENT2	Q05785	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ABF1	P14164	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	RIT1	P23796	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	DSS4	P32601	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YBR138C	P38277	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	POL31	P46957	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ATG4	P53867	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TRS31	Q03337	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	CRD1	Q07560	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	ICL2	Q12031	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	MYO4	P32492	1471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	VTH1	P40438	1549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	VTH2	P40890	1549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TSC11	P40061	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	NUC1	P08466	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	CLB4	P24871	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	VID27	P40157	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	NDC80	P40460	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	MSE1	P48525	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	COS12	P53053	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	SNF12	P53628	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	MFM1	Q02783	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	RKI1	Q12189	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	NUP159	P40477	1460 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRPS35	YGR165W	CTT1	P06115	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	UBS1	P38290	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	YHL017W	P38745	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	CAB2	P40506	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	IML2	P47031	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	STB4	P50104	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	LAM4	P38800	1345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	APL3	P38065	1025 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	PSF2	P40359	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	SMK1	P41808	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	CTR1	P49573	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	VPS64	Q03944	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	UFO1	Q04511	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	SSP2	Q08646	371 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	PUS9	Q12069	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	SSM4	P40318	1319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	BET2	P20133	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	YCL049C	P25577	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	SSH4	P32343	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	PSY4	P38193	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	ARG2	P40360	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	IDS2	P46958	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	ARA2	Q04212	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	ACF2	Q12168	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	VPS15	P22219	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS35	YGR165W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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