RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	KIN3	P22209	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	LRO1	P40345	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	UFO1	Q04511	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	ARR3	Q06598	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	KCC4	P25389	1037 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YIL092W	P40497	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MAD2	P40958	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	TAH11	P47112	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	TIM50	Q02776	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MPD2	Q99316	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	VPS33	P20795	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	ELF1	P36053	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MRPL7	P36519	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	EHT1	P38295	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	IML1	P47170	1584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	NMA2	P53204	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	DIP5	P53388	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	TRI1	Q05024	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	DIN7	Q12086	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	PDR11	P40550	1411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	LAM4	P38800	1345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PHO3	P24031	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SDS22	P36047	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	TAF5	P38129	798 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PPE1	P38796	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YJL193W	P39542	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	THI6	P41835	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YNR071C	P53757	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	STE4	P18851	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	TGL1	P34163	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YLF2	P38746	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SAW1	P39735	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MET14	Q02196	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	NUR1	Q12066	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	HOS1	Q12214	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	RPN13	O13563	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	URA3	P03962	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SEC12	P11655	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	ARG1	P22768	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YKL133C	P36066	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YMC2	P38087	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MUP3	P38734	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MIT1	P40002	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PMT6	P42934	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	ASK10	P48361	1146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MDR1	P53258	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SPC98	P53540	846 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MLC2	Q06580	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	ARP7	Q12406	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	CNE1	P27825	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	TDP1	P38319	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YIL166C	P40445	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PIP2	P52960	996 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	USA1	Q03714	838 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PHO5	P00635	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	GAL1	P04385	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PTP2	P29461	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	EMP70	P32802	667 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YEL020C	P39994	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MFM1	Q02783	413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SUT2	Q12286	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	ENT1	Q12518	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	CAT8	P39113	1433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	ADH4	P10127	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	DSS4	P32601	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	LOT5	P34234	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	PIH1	P38768	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	SWD1	P39706	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	GSM1	P42950	618 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	MRK1	P50873	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YIP4	P53093	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPT15	YER148W	TPK2	P06245	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPT15	YER148W	PCK1	P10963	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPT15	YER148W	CBP3	P21560	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.7 ms