RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 CARNS1A5YM72 827 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 CORO1BQ9BR76 489 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF576Q9H609 170 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.91□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 FAM87AP0C7U9 286 aa6.91□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 FUT4P22083 530 aa6.91□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 USP5P45974 858 aa6.91□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.91□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 TMPRSS2O15393 492 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 LEFTY1O75610 366 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 FAM13AO94988 1023 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 PDE3AQ14432 1141 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 FAM168AQ92567 244 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00520-201ENST00000554186 SHROOM2Q13796 1616 aa6.9□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 DBX1A6NMT0 343 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 LIG1P18858 919 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 DISP1Q96F81 1524 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 SAMD9Q5K651 1589 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ARAP1Q96P48 1450 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF862O60290 1169 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FBLN7Q53RD9 439 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 NETO1Q8TDF5 533 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CEP162Q5TB80 1403 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 BIN1O00499 593 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ABL1P00519 1130 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ITPKAP23677 461 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FAAP100Q0VG06 881 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 IQGAP2Q13576 1575 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ARID3CA6NKF2 412 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ORC1Q13415 861 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 MISP3Q96FF7 219 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ABCB6Q9NP58 842 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 NPHS2Q9NP85 383 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 DISC1Q9NRI5 854 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 OXCT1P55809 520 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 MESP2Q0VG99 397 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ECM1Q16610 540 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 EHD4Q9H223 541 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 NEFMP07197 916 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 PRKCQQ04759 706 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 VAV3Q9UKW4 847 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00520-201ENST00000554186 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 ID3Q02535 119 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 AP3B2Q13367 1082 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 TTLL4Q14679 1199 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 AOC3Q16853 763 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 PIDD1Q9HB75 910 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 CLIP1P30622 1438 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 KIAA0556O60303 1618 aa6.83□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 ITIH2P19823 946 aa6.82□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 KSR1Q8IVT5 923 aa6.82□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.82□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.82□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 CEACAM5P06731 702 aa6.81□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.81□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.81□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.8□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 PKN1Q16512 942 aa6.8□□□□□ -1.32
LINC00520-201ENST00000554186 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms