RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 GNA11P29992 359 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNA5P30532 468 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 STIM1Q13586 685 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 STYK1Q6J9G0 422 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 DACH1Q9UI36 760 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 IGSF3O75054 1194 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC192P0DO97 292 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 MECOMQ03112 1051 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SULF1Q8IWU6 871 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 RXRAP19793 462 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 OSBP2Q969R2 916 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 ECE2O60344 883 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A4P43007 532 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC17Q96LX7 622 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 MTFR1LQ9H019 292 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SHPRHQ149N8 1683 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 LTN1O94822 1766 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JLW4 131 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 M0R2C6 588 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SMC2O95347 1197 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 DEXIO95424 95 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 USP17L8P0C7I0 530 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 NT5C2P49902 561 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TSPY26PQ9H489 355 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 SWAP70Q9UH65 585 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-211ENST00000486161 B4DLN1 442 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 AOC3Q16853 763 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 LCORLQ8N3X6 602 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CSADQ9Y600 493 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 MED23Q9ULK4 1368 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 GOPCQ9HD26 462 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 PRDX5P30044 214 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 KRT2P35908 639 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 SLIT2O94813 1529 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CLRN2A0PK11 232 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 F13A1P00488 732 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 BRAPQ7Z569 592 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CSRNP1Q96S65 589 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 CYP21A2P08686 494 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 UBA7P41226 1012 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 EPS15P42566 896 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 PEAK1Q9H792 1746 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRD-211ENST00000486161 TNKSO95271 1327 aa9.51□□□□□ -0.89
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