RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SREBF2Q12772 1141 aa5.54□□□□□ -1.52
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ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-211ENST00000460558 DLK2Q6UY11 383 aa5.54□□□□□ -1.52
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ECHDC1-211ENST00000460558 COL26A1Q96A83 441 aa5.53□□□□□ -1.52
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ECHDC1-211ENST00000460558 SIAH2O43255 324 aa5.51□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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ECHDC1-211ENST00000460558 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SHTN1A0MZ66 631 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ICMTO60725 284 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD17O75943 681 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMTA2O94983 1202 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFBP4P22692 258 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC39A6Q13433 755 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF6Q15052 776 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 DPF2Q92785 391 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 GGA3Q9NZ52 723 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PSME4Q14997 1843 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFRSF10AO00220 468 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 LILRA1O75019 489 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 NPR3P17342 541 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TCIRG1Q13488 830 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 CRY2Q49AN0 593 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 STAP2Q9UGK3 403 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA1GO43497 2377 aa5.49□□□□□ -1.53
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