RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC69A6NI79 296 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 IFNAR1P17181 557 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 SHC4Q6S5L8 630 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.54■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP12P59046 1061 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 COL4A1P02462 1669 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 BCORQ6W2J9 1755 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0G2JS52 829 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 NEMFO60524 1076 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 TDO2P48775 406 aa18.52■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 NBPF11Q86T75 865 aa18.52■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.52■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 LAMB2P55268 1798 aa18.52■□□□□ 0.56
SHQ1-202ENST00000444040 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM29Q14134 588 aa18.52■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 JMYQ8N9B5 988 aa18.52■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.52■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 MTA3Q9BTC8 594 aa18.52■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 BIN1O00499 593 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SYKP43405 635 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 NCAPHQ15003 741 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 NRAPQ86VF7 1730 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CHD4Q14839 1912 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY1A2P33402 732 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 RESP18Q5W5W9 173 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.51■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS2O95450 1211 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CCZ1BP86790 482 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 WTAPQ15007 396 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 WASF1Q92558 559 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CLIC6Q96NY7 704 aa18.5■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 MMP1P03956 469 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CUTAO60888 179 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CYP7A1P22680 504 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 PPARAQ07869 468 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 RTN1Q16799 776 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TOMM22Q9NS69 142 aa18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 BTBD18B2RXH4 712 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SKILP12757 684 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TNNT1P13805 278 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 RCAN1P53805 252 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TMTC2Q8N394 836 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.48■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 IKBKBO14920 756 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SMTNL1A8MU46 457 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 GYG1P46976 350 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.47■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 ERICH2A1L162 156 aa18.46■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 USP27XA6NNY8 438 aa18.46■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 KCNQ2O43526 872 aa18.46■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 GSDMDP57764 484 aa18.46■□□□□ 0.55
SHQ1-202ENST00000444040 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms