RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TREML1Q86YW5 311 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPACA3Q8IXA5 215 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF280CQ8ND82 737 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF503Q96F45 646 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT43Q96FT9 208 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUSD3Q96L08 255 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA25Q9BR10 227 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LACRTQ9GZZ8 138 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD248Q9HCU0 757 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf16Q9NQ32 467 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPB42P16452 691 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TARSP26639 723 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOS2P35228 1153 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE6BP35913 854 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ICAM4Q14773 271 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLB1LQ6UWU2 654 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LILRA2Q8N149 483 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D2Q9BYX2 928 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMYND15Q9H091 742 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNTD2Q9H8S5 307 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM105AQ9NUU6 356 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRT5Q9NXA8 310 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLAMF8Q9P0V8 285 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM29Q9UKF5 820 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM177BA6PVY3 158 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT86O43790 486 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUSD5O60279 629 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAMP2O60895 175 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPNS1P04632 268 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX18P35713 384 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDR1P51861 262 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP2K5Q13163 448 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK5R2Q13319 367 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT81Q14533 505 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIF1AQ16665 826 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 QPCTQ16769 361 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR16Q569H4 304 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF585AQ6P3V2 769 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLK2Q6UY11 383 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLGN1Q8N2Q7 840 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 MZB1Q8WU39 189 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM255BQ8WV15 326 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF592Q92610 1267 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRX2Q99811 253 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SP110Q9HB58 689 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM59LQ9UK28 342 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCAF1Q9Y4C2 921 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR14I1A6ND48 311 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM38O00635 465 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLGAP3O95886 979 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSAPP07602 524 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADH4P08319 380 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF1BP20333 461 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 HK2P52789 917 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CABP4P57796 275 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP10-3P60369 221 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLCB3Q01970 1234 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTH1RQ03431 593 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKPD1Q17RQ9 610 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUSC1Q2TAM9 212 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWA3BQ502W6 1294 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 IER5Q5VY09 327 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP135Q66GS9 1140 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF207Q6ZRF8 634 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAREM2Q75VX8 874 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIMS2Q7Z4I7 341 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGDCC3Q8IVU1 814 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRN4Q8WUT4 740 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP26Q9BXU7 913 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEF6Q9H4E7 631 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF112Q9UJU3 913 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF232Q9UNY5 417 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GTL3 188 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERTM1A2A2V5 107 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3D21A4FU49 640 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEFTY1O75610 366 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SASH3O75995 380 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUDT3O95989 172 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRAP18433 802 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL4DP49703 201 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTDSPL2Q05D32 466 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf57Q0VDD7 668 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP4Q13107 963 aa0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms