RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 LEFTY1O75610 366 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTLL4Q14679 1199 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 ECM1Q16610 540 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIRREL1Q96J84 757 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT82Q9NSB4 513 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLAIN2Q9P270 581 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPR3P17342 541 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 LIG1P18858 919 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLCN7P51798 805 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTMR7Q9Y216 660 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 NEFLP07196 543 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 INHBBP09529 407 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QTNF9P0C862 333 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTSWP56202 376 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 EHD4Q9H223 541 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 DISC1Q9NRI5 854 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 FZD6O60353 706 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTMR3Q13615 1198 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU2-38P-201ENST00000410856 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF862O60290 1169 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT1P04264 644 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM253P0C7T8 217 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNA10Q16322 511 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 FYB2Q5VWT5 728 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC120Q96HB5 630 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF214Q8ND24 703 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ISL2Q96A47 359 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 DIRC2Q96SL1 478 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABCB6Q9NP58 842 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD320Q9NPF0 282 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NEFMP07197 916 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 MED14OSP0DP75 135 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 GDNFP39905 211 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPHS2Q9NP85 383 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 GLDCP23378 1020 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERVK-24P63145 666 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXQ1Q9C009 403 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 JAG2Q9Y219 1238 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUAK1O60285 661 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAC2P15153 192 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNB2Q92953 911 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 SSFA2P28290 1259 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC00310P59036 64 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAAP100Q0VG06 881 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 USPL1Q5W0Q7 1092 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU2-38P-201ENST00000410856 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXA5P20719 270 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDZD3Q86UT5 571 aa4.65□□□□□ -1.67
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