RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 AIDAQ96BJ3 306 aa25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 FZD1Q9UP38 647 aa25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 MYH7P12883 1935 aa25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PICALMQ13492 652 aa25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 TEX11Q8IYF3 940 aa25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 STAP2Q9UGK3 403 aa25.16■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PDE4AP27815 886 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PDE1AP54750 535 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PPP4CP60510 307 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.14■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PDE6AP16499 860 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 CSRNP1Q96S65 589 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 WBP1LQ9NX94 342 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 CSADQ9Y600 493 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.13■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.613e-8■■■■□ 23
C4orf48-201ENST00000409248 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.12■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 LAMB1P07942 1786 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 WRNIP1Q96S55 665 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.11■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K9P80192 1104 aa25.1■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.1■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 CA12O43570 354 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 VGLL4Q14135 290 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 SPRYD7Q5W111 196 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 FLT1P17948 1338 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.09■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 WNK4Q96J92 1243 aa25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZIC5Q96T25 663 aa25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ADD2P35612 726 aa25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ELP3Q9H9T3 547 aa25.07■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SREBF2Q12772 1141 aa25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 PCNTO95613 3336 aa25.06■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 USP5P45974 858 aa25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 UBE3CQ15386 1083 aa25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 MYH1P12882 1939 aa25.05■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 FOXN1O15353 648 aa25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SKAP1Q86WV1 359 aa25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 OPTNQ96CV9 577 aa25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 DOCK1Q14185 1865 aa25.04■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.03■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 TTC22Q5TAA0 569 aa25.03■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SIPA1L1O43166 1804 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D12O60347 775 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 HLA-DOAP06340 250 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 INPP5BP32019 993 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K10Q02779 954 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 ERO1BQ86YB8 467 aa25.02■■□□□ 1.6
C4orf48-201ENST00000409248 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.02■■□□□ 1.6
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