RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362390.1

RNU6-874P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 874, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-874P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-874P-201ENST00000362390 SLFN14P0C7P3 912 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 ECM1Q16610 540 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-874P-201ENST00000362390 B8ZZF3 427 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRT1P04264 644 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 NEFMP07197 916 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SSFA2P28290 1259 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZP2Q05996 745 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 FAAP100Q0VG06 881 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 IKZF1Q13422 519 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ANKLE2Q86XL3 938 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 EHD4Q9H223 541 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 C1QTNF9P0C862 333 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ASB11Q8WXH4 323 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ABCB6Q9NP58 842 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 NPHS2Q9NP85 383 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ISL2Q96A47 359 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 MTMR7Q9Y216 660 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ARID3CA6NKF2 412 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 GLI1P08151 1106 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 AFMP43652 599 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRT82Q9NSB4 513 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ORC1Q13415 861 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PDZD3Q86UT5 571 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KIRREL1Q96J84 757 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ABL1P00519 1130 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 NFIBO00712 420 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 INHBBP09529 407 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 C14orf37Q86TY3 774 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 RNF214Q8ND24 703 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 STK35Q8TDR2 534 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KCNB2Q92953 911 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 DIRC2Q96SL1 478 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 KCNK12Q9HB15 430 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-874P-201ENST00000362390 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 CLCN7P51798 805 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 NEFLP07196 543 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 NTF4P34130 210 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 ERVK-24P63145 666 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 GRM2Q14416 872 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 CCDC74AQ96AQ1 378 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 CD320Q9NPF0 282 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 EOMESO95936 686 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 GDNFP39905 211 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-874P-201ENST00000362390 CTSWP56202 376 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms