RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Klhdc9Q3USL1 350 aa20.51■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sv2cQ69ZS6 727 aa20.51■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa20.51■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adgra3Q7TT36 1310 aa20.51■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cntnap3E9PY62 1287 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cyp24a1Q64441 514 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Garem2Q6PAJ3 880 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dcaf15Q6PFH3 600 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Htra3Q9D236 459 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam205a1D3YZF6 1314 aa20.5■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Krt28A6BLY7 462 aa20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PtpraP18052 829 aa20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Wdr70Q3TWF6 657 aa20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Amer2Q8CCJ4 672 aa20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hoxd10P28359 340 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eps15P42567 897 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Esyt2Q3TZZ7 845 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc16a10Q3U9N9 512 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam155aQ8CCS2 467 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 1700018B08RikQ9DA83 213 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cxcl11Q9JHH5 100 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dicer1Q8R418 1916 aa20.48■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Vps54Q5SPW0 977 aa20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stac3Q8BZ71 360 aa20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rnf208Q8K0W3 265 aa20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 SynrgQ5SV85 1306 aa20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myh3P13541 1940 aa20.47■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 L3mbtl2P59178 703 aa20.46■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zbtb45Q52KG4 520 aa20.46■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc45a1Q8BIV7 751 aa20.46■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gpsm2Q8VDU0 679 aa20.46■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 DnttP09838 530 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CtshP49935 333 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dynll1P63168 89 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 SelpQ01102 768 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Olfm4Q3UZZ4 505 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppm1gQ61074 542 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adck5Q80V03 582 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Olfm5Q8BU90 496 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Itm2cQ91VK4 269 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Med23Q80YQ2 1367 aa20.45■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm13128L7MU96 475 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Psmc4P54775 418 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rpusd2Q149F1 553 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pdlim7Q3TJD7 457 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Golim4Q8BXA1 655 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prkag2Q91WG5 566 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gpr37l1Q99JG2 481 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Frmpd4A2AFR3 1320 aa20.44■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Irf5P56477 497 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lmod1Q8BVA4 595 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sgpl1Q8R0X7 568 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pla2g12bQ99P27 195 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rdm1Q9CQK3 281 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Elp3Q9CZX0 547 aa20.43■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm8882E9Q7E4 283 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nck2O55033 380 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Vcam1P29533 739 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam178bQ24JP3 464 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam205cQ80YD3 371 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Leng1Q9DB98 261 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dclk1Q9JLM8 756 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Acot3Q9QYR7 432 aa20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Krt24A1L317 512 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 B020004C17RikJ3QP07 232 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Has3O08650 554 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 FlgP11088 336 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 KhnynQ80U38 671 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ngly1Q9JI78 651 aa20.41■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mms22lB1AUR6 1238 aa20.4■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sept12Q9D451 317 aa20.4■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znhit2Q9QY66 399 aa20.4■□□□□ 0.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gas1Q01721 343 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmed8Q3UHI4 326 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam196bQ6GQV1 535 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pramel6Q810Y9 485 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mov10l1Q99MV5 1187 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fsip1Q9D3V5 435 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 IcoslgQ9JHJ8 322 aa20.39■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Igsf9bE9PZ19 1328 aa20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nf2P46662 596 aa20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gjc2Q8BQU6 440 aa20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plxnb2B2RXS4 1842 aa20.38■□□□□ 0.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ThbdP15306 577 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms