Protein–RNA interactions for Protein: Q01721

Gas1, Growth arrest-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gas1Q01721 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
Gas1Q01721 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Gas1Q01721 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Gas1Q01721 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Gas1Q01721 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Gas1Q01721 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Gas1Q01721 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Gas1Q01721 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Gas1Q01721 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Gas1Q01721 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Gas1Q01721 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Gas1Q01721 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Gas1Q01721 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Gas1Q01721 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Gas1Q01721 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Gas1Q01721 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Gas1Q01721 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Gas1Q01721 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gas1Q01721 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Gas1Q01721 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Gas1Q01721 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Gas1Q01721 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gas1Q01721 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gas1Q01721 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gas1Q01721 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Gas1Q01721 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Gas1Q01721 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Gas1Q01721 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gas1Q01721 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
Gas1Q01721 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gas1Q01721 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gas1Q01721 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gas1Q01721 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gas1Q01721 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gas1Q01721 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Gas1Q01721 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gas1Q01721 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gas1Q01721 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gas1Q01721 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gas1Q01721 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gas1Q01721 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gas1Q01721 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gas1Q01721 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gas1Q01721 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gas1Q01721 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gas1Q01721 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gas1Q01721 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Gas1Q01721 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Gas1Q01721 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Gas1Q01721 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Gas1Q01721 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gas1Q01721 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gas1Q01721 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gas1Q01721 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gas1Q01721 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gas1Q01721 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gas1Q01721 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gas1Q01721 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gas1Q01721 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gas1Q01721 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gas1Q01721 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gas1Q01721 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gas1Q01721 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Gas1Q01721 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Gas1Q01721 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gas1Q01721 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Gas1Q01721 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gas1Q01721 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gas1Q01721 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gas1Q01721 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Gas1Q01721 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gas1Q01721 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gas1Q01721 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gas1Q01721 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gas1Q01721 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gas1Q01721 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gas1Q01721 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gas1Q01721 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gas1Q01721 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gas1Q01721 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gas1Q01721 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Gas1Q01721 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gas1Q01721 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Gas1Q01721 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Gas1Q01721 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Gas1Q01721 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gas1Q01721 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Gas1Q01721 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gas1Q01721 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Gas1Q01721 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Gas1Q01721 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gas1Q01721 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gas1Q01721 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gas1Q01721 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gas1Q01721 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gas1Q01721 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gas1Q01721 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Gas1Q01721 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gas1Q01721 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gas1Q01721 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms