RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Phldb3E9QAF4 648 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mapkapk5O54992 473 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HelbQ6NVF4 1074 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CpdO89001 1377 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sh3bp1P55194 680 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MycbpapQ5SUV2 932 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ccp110Q7TSH4 1004 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sept9Q80UG5 583 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sirt2Q8VDQ8 389 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slit1Q80TR4 1531 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pla2g4bP0C871 782 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il7P10168 154 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wnt7aP24383 349 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bsdc1Q80Y55 427 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Jmjd4Q8BFT6 427 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Alx1Q8C8B0 326 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nod2Q8K3Z0 1020 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ank1Q02357 1862 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Speer4dL7N216 212 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Znf496Q5SXI5 585 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zswim4Q8C7B8 1101 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Siglec1Q62230 1695 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cdc37Q61081 379 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cyp4x1Q6A152 507 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 RbsnQ80Y56 783 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mtmr6Q8VE11 617 aa20.4■□□□□ 0.86
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dennd3A2RT67 1274 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cdcp1Q5U462 833 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Stk39Q9Z1W9 556 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arhgef16Q3U5C8 713 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cadps2Q8BYR5 1297 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ints4Q8CIM8 964 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nek9Q8K1R7 984 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cnpy3Q9DAU1 276 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SelenooQ9DBC0 667 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lonp2Q9DBN5 852 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kcnq5Q9JK45 933 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bcl9Q9D219 1425 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zscan20B2KFW1 1030 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gjb4Q02738 266 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cyp7b1Q60991 507 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Esco1Q69Z69 843 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Foxo4Q9WVH3 505 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Stx8O88983 236 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pde11aP0C1Q2 933 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam83bQ0VBM2 1012 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ankrd1Q9CR42 319 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trip6Q9Z1Y4 480 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Exoc5Q3TPX4 708 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Usp50Q6P8X6 390 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ankk1Q8BZ25 745 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nup133Q8R0G9 1155 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Med23Q80YQ2 1367 aa20.38■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 1700013D24RikQ0P521 120 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam89aQ14BJ1 175 aa20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mns1Q61884 491 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc39a11Q8BWY7 342 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Evc2Q8K1G2 1220 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cbx6Q9DBY5 414 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bnip3O55003 187 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Brinp3Q499E0 766 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc38a10Q5I012 1090 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slitrk3Q810B9 980 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Terb1Q8C0V1 768 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mylk2Q8VCR8 613 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm4340L7N2C4 268 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 LtbrP50284 415 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rgs12Q8CGE9 1381 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Setdb1O88974 1307 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Plbd2Q3TCN2 594 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc27a1Q60714 646 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Madcam1Q61826 405 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ces3aQ63880 571 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spag5Q7TME2 1165 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ces3bQ8VCU1 571 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 NsmfQ99NF2 532 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Myh1Q5SX40 1942 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hap1O35668 628 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Usp53P15975 1069 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Eva1cP58659 440 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mdh1bQ5F204 500 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptpra-201ENSMUST00000028769 NenfQ9CQ45 171 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.1 ms