RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.98□□□□□ -0.81
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RABGEF1-202ENST00000380828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-202ENST00000380828 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
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RABGEF1-202ENST00000380828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGEF1-202ENST00000380828 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-202ENST00000380828 STAC3Q96MF2 364 aa9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF428Q96B54 188 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-202ENST00000380828 TOP2BQ02880 1626 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.38□□□□□ -0.91
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.38□□□□□ -0.91
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