RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 H0Y8G0 127 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB4AO15263 64 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS1P07477 247 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00694P0DN24 101 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 COTL1Q14019 142 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 ODF1Q14990 250 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.06■□□□□ 0.16
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CAPNS1-207ENST00000589146 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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CAPNS1-207ENST00000589146 CELA1Q9UNI1 258 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087WX48 190 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE12JA6NER3 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 K7EIL1 84 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYBA4P53673 196 aa16.04■□□□□ 0.16
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CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE5Q13069 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE13Q4V321 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 ATOH7Q8N100 152 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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CAPNS1-207ENST00000589146 BAALCQ8WXS3 180 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 RETNQ9HD89 108 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 PRO0255Q9UI72 69 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.02■□□□□ 0.16
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CAPNS1-207ENST00000589146 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 TSTD3H0UI37 97 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5G1P05496 136 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA45Q537H7 98 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PRO1933Q9H354 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 MAJINQ3KP22 176 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 SPANXA1Q9NS26 97 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 F8VRH5 84 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 DPM2O94777 84 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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CAPNS1-207ENST00000589146 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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CAPNS1-207ENST00000589146 CST9LQ9H4G1 147 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 hDV102S1A0JD36 115 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX4O43316 350 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 GYPEP15421 78 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf74Q32Q52 190 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM104AQ969W3 186 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 PLNP26678 52 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 H7C423 109 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 AMELXQ99217 191 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLC3P0DOY3 106 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM243Q9BU79 118 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 DDTP30046 118 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 VCX2Q9H322 139 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 F5H768 121 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 NOTCH1P46531 2555 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0J9YWU9 116 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 STPG4Q8N801 248 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BNG1 76 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-207ENST00000589146 FGF6P10767 208 aa15.86■□□□□ 0.13
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