RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD39Q53RE8 183 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-210ENST00000574322 STPG4Q8N801 248 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS29PA6NIE9 313 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 COX8AP10176 69 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A34Q6PIV7 304 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A29Q8N8R3 303 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KRTAP10-11P60412 298 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNRF2Q8NHG8 242 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHCHD7Q9BUK0 85 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 COTL1Q14019 142 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB135Q30KP9 77 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FHL2Q14192 279 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SNHG12Q9BXW3 62 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CRYBA4P53673 196 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-210ENST00000574322 DLEU1O43261 78 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR11H2Q8NH07 326 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.13■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF183Q96D59 192 aa20.13■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa20.12■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB130AP0DP74 79 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q8NAQ8 132 aa20.09■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GAGE1Q13065 139 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GAGE5Q13069 117 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAGE13Q4V321 117 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM222AQ5U5X8 452 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRADC1Q9BSG0 188 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTSF1LQ9H1H1 148 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00694P0DN24 101 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 NMUP48645 174 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VCX2Q9H322 139 aa20.06■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 SIVA1O15304 175 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf91Q6ZV80 131 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 C11orf86A6NJI1 115 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa20.05■□□□□ 0.8
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 SBSPONQ8IVN8 264 aa20.02■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAH3Q8TD57 4116 aa20.02■□□□□ 0.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa20.02■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 E9PLD3 99 aa20■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa20■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRO0255Q9UI72 69 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMAGPQ0VAQ4 97 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 H7C423 109 aa19.96■□□□□ 0.79
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