RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R17	O96001	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	NTF3	P20783	257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139		Q0VG73	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139		Q1RN00	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ANK2	Q01484	3957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC01587	Q99440	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ATR	Q13535	2644 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		M0R381	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	SRI	P30626	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	VWF	P04275	2813 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		A8MWV9	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		M0R2P5	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	GNRH2	O43555	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	ESD	P10768	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	FXYD7	P58549	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		U3KQK5	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		H7C1H1	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		K7EMI3	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB4A	P20338	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A2	P29034	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	CKS2	P33552	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFA6	P56556	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZQT7	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		D6R8Y8	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	TCAP	O15273	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139		A6NDN8	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MIF	P14174	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	HTN1	P15515	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	EVI2A	P22794	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	MGP	P08493	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00614	P0C842	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	G0S2	P27469	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF56	Q15929	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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