RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-205ENST00000502260 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-205ENST00000502260 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-205ENST00000502260 CNFNQ9BYD5 112 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-205ENST00000502260 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP2-205ENST00000502260 LINC01620Q4KN68 170 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-205ENST00000502260 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.07□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-205ENST00000502260 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-205ENST00000502260 MPV17L2Q567V2 206 aa9.05□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 OXTP01178 125 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-205ENST00000502260 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.04□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 HIGD1CA8MV81 97 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP2-205ENST00000502260 RBX1P62877 108 aa9.01□□□□□ -0.97
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SH3BP2-205ENST00000502260 GAS8-AS1O95177 125 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 HLA-DQA1P01909 254 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB4AP20338 218 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 PMCHP20382 165 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 REG3AQ06141 175 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-205ENST00000502260 AMN1Q8IY45 258 aa8.95□□□□□ -0.98
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