RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497183.5

PRKCZ-223, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-223	ENST00000497183	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A087WWL8	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		A8MWV9	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	S100A2	P29034	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q0VG73	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF56	Q15929	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PTH2	Q96A98	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	JPT2	Q9H910	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	NCR2	O95944	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PPP1R17	O96001	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	RHOD	O00212	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	EREG	O14944	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	CRYGD	P07320	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	RASL10A	Q92737	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183		H7C1H1	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	RS1	O15537	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	HSBP1	O75506	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	SERF1A	O75920	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NPY	P01303	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00614	P0C842	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	CRYBA4	P53673	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	FHL2	Q14192	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NIT1	Q86X76	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	CIDEA	O60543	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	PMCH	P20382	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	AKR1D1	P51857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	WFDC2	Q14508	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	PAX4	O43316	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NUPR1	O60356	82 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	ESD	P10768	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	FABP4	P15090	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	AMT	P48728	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q8N814	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q8N8P6	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NRAC	Q8N912	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183		K7EP13	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183		K7EQD1	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCZ-223	ENST00000497183	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms