RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 OR11H2Q8NH07 326 aa12.05□□□□□ -0.48
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TOM1-216ENST00000492723 SEC11AP67812 179 aa12.04□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 ZNF479Q96JC4 524 aa12.04□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.04□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 HIGD1BQ9P298 99 aa12.04□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 TAX1BP3O14907 124 aa12.03□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.03□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.03□□□□□ -0.48
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.03□□□□□ -0.48
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TOM1-216ENST00000492723 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
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TOM1-216ENST00000492723 K7EP13 123 aa11.96□□□□□ -0.49
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TOM1-216ENST00000492723 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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TOM1-216ENST00000492723 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.95□□□□□ -0.5
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TOM1-216ENST00000492723 AMELXQ99217 191 aa11.94□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 HIST1H4GQ99525 98 aa11.94□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.94□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 GAGE12JA6NER3 117 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 H3BRM9 83 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 GAGE4Q13068 117 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 GAGE5Q13069 117 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 GAGE13Q4V321 117 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 F8P00451 2351 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 RAB37Q96AX2 223 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 TM2D2Q9BX73 214 aa11.93□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 CRYBA4P53673 196 aa11.92□□□□□ -0.5
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TOM1-216ENST00000492723 TAL2Q16559 108 aa11.92□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZUT4 128 aa11.91□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.91□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 TMEM223A0PJW6 202 aa11.91□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 UBE2D3P61077 147 aa11.91□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 UBE2D2P62837 147 aa11.91□□□□□ -0.5
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TOM1-216ENST00000492723 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 SMIM13P0DJ93 91 aa11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 C9orf118A6NHY6 69 aa11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 J3QQQ9 107 aa11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TOM1-216ENST00000492723 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
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