RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 CDSNQ15517 529 aa10.12□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZSV7 163 aa10.12□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.12□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 CRYGBP07316 175 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 F8W1H4 67 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 K7EP34 96 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 TIMM17AQ99595 171 aa10.11□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 IFITM1P13164 125 aa10.1□□□□□ -0.79
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HDLBP-241ENST00000487169 A4D1N5 150 aa10.1□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 F8W735 103 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.1□□□□□ -0.79
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.1□□□□□ -0.79
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HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZTI0 123 aa10.09□□□□□ -0.79
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HDLBP-241ENST00000487169 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.08□□□□□ -0.8
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.08□□□□□ -0.8
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HDLBP-241ENST00000487169 TAX1BP3O14907 124 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
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HDLBP-241ENST00000487169 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.03□□□□□ -0.8
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HDLBP-241ENST00000487169 PSMB8P28062 276 aa10.02□□□□□ -0.81
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HDLBP-241ENST00000487169 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 CRYBA4P53673 196 aa9.99□□□□□ -0.81
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HDLBP-241ENST00000487169 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 HIGD1BQ9P298 99 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.99□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 CXCL5P42830 114 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-9P60411 292 aa9.98□□□□□ -0.81
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