RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM141Q96I45 108 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GPHB5Q86YW7 130 aa12.11□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.11□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.11□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 LEPROTO15243 131 aa12.1□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.1□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YXY3 114 aa12.1□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.1□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MOB4Q9Y3A3 225 aa12.1□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-69P01742 117 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf139Q6ZV77 190 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EDN2P20800 178 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PRB1P04280 392 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0B4J2C4 111 aa12.08□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.08□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 P0DMU3 169 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 FAM231AP0DMU4 169 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 FAM231CP0DMU5 169 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PRORYQ9H606 182 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM17AQ99595 171 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM223A0PJW6 202 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 RNF223E7ERA6 249 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 OVOL1O14753 267 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MUC4Q99102 2169 aa12.06□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KNCNA6PVL3 124 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 I3L3M4 83 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 AVPP01185 164 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 Q6Q795 121 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 AMELXQ99217 191 aa12.04□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM126AQ9H061 195 aa12.04□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MDFICQ9P1T7 246 aa12.04□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 HERVK_113P63121 156 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.02□□□□□ -0.48
CCSAP-204ENST00000483092 NOTCH2Q04721 2471 aa12.02□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.02□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.02□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.01□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 H3BT86 120 aa12.01□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RHOHQ15669 191 aa12.01□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MSMBP08118 114 aa12□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TEX15Q9BXT5 2789 aa12□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.99□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01587Q99440 93 aa11.99□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-59P01825 116 aa11.99□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.99□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA7O95182 113 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 USP24Q9UPU5 2620 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NXPH4O95158 308 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 hADV29S1A0JD25 119 aa11.98□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00315P59091 139 aa11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FAM223BA6NKX1 122 aa11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.97□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 LST1O00453 97 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PROK1P58294 105 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 Q9HAA7 133 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FBN2P35556 2912 aa11.96□□□□□ -0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.96□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WW49 117 aa11.96□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.96□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SYNJ2BPP57105 145 aa11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.95□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 M0QY20 66 aa11.94□□□□□ -0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PRM2P04554 102 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.8 ms