RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5G1P05496 136 aa12.52□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIGD1BQ9P298 99 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTH2Q96A98 100 aa12.52□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED14OSP0DP75 135 aa12.51□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.51□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EBI3Q14213 229 aa12.49□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EQG2 157 aa12.48□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.48□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-11P01706 119 aa12.47□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.47□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZS46 218 aa12.46□□□□□ -0.41
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.44□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.44□□□□□ -0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.43□□□□□ -0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PROK1P58294 105 aa12.43□□□□□ -0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6YL49 198 aa12.41□□□□□ -0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRO0255Q9UI72 69 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.4□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.39□□□□□ -0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GX51 115 aa12.39□□□□□ -0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS9O00182 355 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPAG11BQ08648 103 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N6K4 173 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YGX0 51 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCR3O14931 201 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZSV7 163 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFE4Q86UQ8 179 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.37□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0J9YXY3 114 aa12.37□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0B4J2C4 111 aa12.36□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0QY20 66 aa12.36□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP24Q9UPU5 2620 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCL1BO95988 128 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL18P55774 89 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.35□□□□□ -0.43
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