RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SORL1Q92673 2214 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NIN4 97 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 GNG4P50150 75 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6AWC8 147 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CREBBPQ92793 2442 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PREX2Q70Z35 1606 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 MROH1Q8NDA8 1641 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 POLQO75417 2590 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2G1P62253 170 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 UGGT1Q9NYU2 1555 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 FRYQ5TBA9 3013 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 C20orf202A1L168 122 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFP01375 233 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 APOC2P02655 101 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TPPP2P59282 170 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TSKUQ8WUA8 353 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PZPP20742 1482 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SPG11Q96JI7 2443 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 MAST1Q9Y2H9 1570 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 KCPQ6ZWJ8 1503 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP3R1P63098 170 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZS92 163 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRK2Q5S007 2527 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAPERQ9BY12 1400 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CBLN1P23435 193 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf144Q96I85 54 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RPRMQ9NS64 109 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 NOTCH1P46531 2555 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TECTAO75443 2155 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 ERICH3Q5RHP9 1530 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 DAPK1P53355 1430 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH23Q9H251 3354 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 LYNX1P0DP58 116 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf73Q69YU5 71 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 PKD1L3Q7Z443 1732 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NCR3O14931 201 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 CATR1Q13166 79 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 XAF1Q6GPH4 301 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA6Q8N139 1617 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP1Q9C000 1473 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFHX3Q15911 3703 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 ATRQ13535 2644 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PCH4 1651 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC37A3O60309 1634 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 PRB1P04280 392 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 FXYD3Q14802 87 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 AMELYQ99218 206 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA1HO95180 2353 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 FBN2P35556 2912 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 MYOM2P54296 1465 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NWD2Q9ULI1 1742 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 FLNCQ14315 2725 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-209ENST00000473406 NPC2P61916 151 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms