RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOHQ15669 191 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf85Q96MD7 179 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 Q9UF83 564 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BT86 120 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 PRORYQ9H606 182 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.97□□□□□ -0.81
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SH3BP1-206ENST00000469947 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CUBNO60494 3623 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 PRM2P04554 102 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM104AQ969W3 186 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.96□□□□□ -0.82
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BUX3 64 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 ID1P41134 155 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0U1RRA0 63 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXCQ9NY87 97 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 LST1O00453 97 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 USMG5Q96IX5 58 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 COX6CP09669 75 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 MIAQ16674 131 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 NACAE9PAV3 2078 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX5Q96PT3 197 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01587Q99440 93 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHG2P01859 326 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP1-206ENST00000469947 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.89□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM126AQ9H061 195 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 FLNCQ14315 2725 aa9.87□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV1-40P01703 118 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 GNLYP22749 145 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 SYNJ2BPP57105 145 aa9.85□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 A6NDX4 124 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BUA1 57 aa9.85□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.85□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM17BO60830 172 aa9.84□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.84□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 Q8N2B8 174 aa9.84□□□□□ -0.83
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SH3BP1-206ENST00000469947 K7EMT4 169 aa9.83□□□□□ -0.84
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SH3BP1-206ENST00000469947 Q9H8V8 135 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA7O95182 113 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf84I3L1E1 186 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 CFHR3Q02985 330 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.81□□□□□ -0.84
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